Boletim de Serviço Eletrônico em 27/02/2023

 

 

Ministério da Educação

UNIVERSIDADE TECNOLÓGICA FEDERAL DO PARANÁ

DIRETORIA DE PESQUISA E PÓS-GRADUAÇÃO - CAMPUS CORNÉLIO PROCÓPIO

PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO ASSOCIADO EM BIOINFORMÁTICA - CP

 

EDITAL nº 01/2023

INSCRIÇÃO E SELEÇÃO NO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO ASSOCIADO EM BIOINFORMÁTICA, NÍVEL DOUTORADO, DA UNIVERSIDADE TECNOLÓGICA FEDERAL DO PARANÁ - CÂMPUS CORNÉLIO PROCÓPIO

CURSO DE DOUTORADO EM BIOINFORMÁTICA - FLUXO CONTÍNUO - TURMA 2023

 

 

O Colegiado do Programa de Pós-graduação em Associado em Bioinformática, no uso das suas atribuições legais e regimentais, considerando:

RESOLVE:

Estabelecer datas, critérios e procedimentos para a seleção e admissão ao Curso de Doutorado do Programa de Pós-graduação Associado em Bioinformática - Sede UTFPR, na forma deste Edital.

 

DA ABRANGÊNCIA

     Art. 1 Aplica-se este edital ao processo de seleção para o ingresso no Curso de Doutorado do Programa de Pós-graduação Associado em Bioinformática - Sede UTFPR, daqui para frente denominado Programa, para o ingresso em 2023. As candidaturas serão avaliadas continuamente, segundo cronograma e disponibilidade de vaga durante a vigência deste edital.

 

DAS VAGAS

                 Parágrafo único. A seleção para eventual bolsa de estudo ocorrerá em um edital específico.

 

DAS INSCRIÇÕES

     Art. 4 Para efetivação da inscrição, o(a) candidato(a) deverá enviar os seguintes documentos digitalizados:

DA BANCA DO PROCESSO SELETIVO

     Art. 7 A seleção será coordenada por uma Comissão de Seleção composta por professores membros do Programa e designada pelo Colegiado do Programa.

                               Parágrafo único. O servidor ou terceiro que integrar a banca examinadora deverá comunicar à Comissão de Seleção, por escrito, quaisquer das hipóteses de impedimento e suspeição mencionadas no caput.

 

DO PROCESSO SELETIVO

 

Etapa*

Datas

Período de Inscrição

A partir de 27/02/2023, por Fluxo Contínuo

Resultado das inscrições deferidas e indeferidas

Até 10 dias úteis do recebimento da inscrição

Recurso das inscrições indeferidas

Até 48 horas a partir do resultado das inscrições indeferidas

Resultado das inscrições após recurso

Até 5 dias úteis a partir do encaminhamento do recurso

Divulgação resultado preliminar

Até 15 dias úteis após resultado das inscrições após recurso

Recurso do resultado preliminar

Até 48 horas após o resultado preliminar

Resultado final

Até 5 dias úteis após o recurso

* Observação: todos os resultados serão divulgados cumulativamente no sítio do Programa.


 

                   Parágrafo único. A alteração de data de uma das etapas implica alteração equivalente em todo o cronograma, sem prejuízo dos prazos regulamentares.

 

DAS DISPOSIÇÕES GERAIS

 

Cornélio Procópio, 24 de fevereiro de 2023.

Colegiado do Programa de Pós-graduação Associado em Bioinformática.

 

 


logotipo

Documento assinado eletronicamente por (Document electronically signed by) MARCIO JACOMETTI, DIRETOR(A)-GERAL, em (at) 24/02/2023, às 16:56, conforme horário oficial de Brasília (according to official Brasilia-Brazil time), com fundamento no (with legal based on) art. 4º, § 3º, do Decreto nº 10.543, de 13 de novembro de 2020.


logotipo

Documento assinado eletronicamente por (Document electronically signed by) FABRICIO MARTINS LOPES, COORDENADOR(A) DE CURSO/PROGRAMA, em (at) 27/02/2023, às 10:50, conforme horário oficial de Brasília (according to official Brasilia-Brazil time), com fundamento no (with legal based on) art. 4º, § 3º, do Decreto nº 10.543, de 13 de novembro de 2020.


QRCode Assinatura

A autenticidade deste documento pode ser conferida no site (The authenticity of this document can be checked on the website) https://sei.utfpr.edu.br/sei/controlador_externo.php?acao=documento_conferir&id_orgao_acesso_externo=0, informando o código verificador (informing the verification code) 3278682 e o código CRC (and the CRC code) B01B6EF8.



ANEXO I – QUADRO DE VAGAS – EDITAL Nº 01/2023-PPGAB-UTFPR-CP

1. O(a) candidato(a) deverá escolher um único tema de pesquisa para concorrer, a qual deverá ser abordada no projeto de pesquisa do(a) candidato(a). 

Tabela de vagas disponíveis por temas de pesquisa:

Linhas de Pesquisa

Temas para os Projetos de Pesquisa

Vagas *

Biologia Computacional



 

Análise e integração de dados biológicos (e.g., Non-coding RNAs, Elementos transponíveis)

Tema 1: Integração de dados e exploração do conhecimento em dados biológicos
Tema 2: Análise de dados e inteligência artificial em problemas biológicos

2

Desenvolvimento de algoritmos e arcabouços computacionais para a Bioinformática

Tema 1: Análise de sequências biológicas utilizando modelos probabilísticos.

Tema 2: Desenvolvimento de algoritmos em grafos aplicados para problemas da Bioinformática

2

Análise e Predição de sequências biológicas

Tema 1: Técnicas de aprendizado de máquina aplicado na predição de lncRNA multirrótulo.

Tema 2: Estudos de sequências biológicas baseados na engenharia de features.

2

Análise e aplicação de redes complexas e teoria da informação em Bioinformática

Tema 1: Estudo de medidas de informação, topológicas e espectrais de grafos e algoritmos na inferência e avaliação de redes biológicas.

Tema 2: Estudo de redes complexas e teoria da informação aplicadas na síntese e análise de dados biológicos.

2

Aprendizado de máquina profundo (deep learning) em dados biológicos

Tema 1: Técnicas de aprendizado de máquina profundo e variantes aplicadas a dados biológicos

Tema 2: Visão computacional agregada a aprendizado de máquina em dados complexos biológicos (imagens, vídeos, sequências, etc)

4

Biologia Estrutural e Funcional

Caracterização Molecular da interação soja-fitopatógenos

Tema 1: Caracterização de rotas biológicas de P. pachyrhizi

Tema 2:  Identificação de genes de P. pachyrhizi essenciais e sua patogenicidade em soja

2

Total

 

14

*Conforme Art. 2 deste Edital, o quadro de vagas será continuamente atualizado em edital suplementar, até o preenchimento das vagas.

 

ANEXO II – QUADRO DOCENTE DO PPGAB-UFPR COM CAPACIDADE DE ORIENTAÇÃO PARA O EDITAL Nº 01/2023-PPGAB-UTFPR-CP

Docente

Linhas de Pesquisa

CV Lattes

Alexandre R. Paschoal

Biologia Computacional

http://lattes.cnpq.br/5834088144837137

Andre Y. Kashiwabara

Biologia Computacional

http://lattes.cnpq.br/3194328548975437

Danilo S. Sanches

Biologia Computacional

http://lattes.cnpq.br/6377657274398145

Fabrício M. Lopes

Biologia Computacional

http://lattes.cnpq.br/1660070580824436

Francismar C. Marcelino−Guimarães

Biologia Estrutural e Funcional

http://lattes.cnpq.br/4585015105548818

Pedro Henrique Bugatti

Biologia Computacional

http://lattes.cnpq.br/2177467029991118

Priscila T. M. Saito

Biologia Computacional

http://lattes.cnpq.br/6652293216938994

 

 

 

ANEXO III – MODELO DO PROJETO DE PESQUISA

1. Identificação do Projeto de Pesquisa (1 página)

Nome do Candidato(a):

Título do Projeto:

Tema do Projeto de Pesquisa (indicar apenas um, conforme Anexo I):

Linha de Pesquisa (indicar apenas uma, conforme Anexo I):

Professor Orientador (indicar apenas um, conforme Anexo II):

 

2. Resumo (1 página)

 

3. Introdução (até 3 páginas)

Apresentação e contextualização da proposta e caracterização do problema.

 

4. Justificativa (até 2 páginas)

 

5. Objetivos (1 página)

Objetivos gerais e específicos.

 

6. Revisão Bibliográfica (até 5 páginas)

Fundamentação Teórica. Descrever a importância do problema e as propostas de solução, com base em literatura pertinente.

 

7. Metodologia (até 5 páginas)

Descrever a metodologia a ser utilizada para o desenvolvimento do projeto.

 

8. Resultados e/ou Produtos e/ou Contribuições esperadas (até 2 páginas)

 

9. Cronograma (1 página)

Identificar as principais atividades a serem desenvolvidas no projeto para atingir o objetivo proposto e o respectivo tempo para a realização.

 

10. Bibliografia (até 10 páginas)

Listar as principais referências bibliográficas, citadas no texto, de acordo com as normas da ABNT.


 

Local e data: _________________, ______ de _______________ de 20__.


 

____________________________________

Assinatura do Candidato

 

OBSERVAÇÃO: o projeto deve ter no máximo vinte (20) páginas, sendo que os itens “Identificação” e “Bibliografia” não entram neste limite.


 

ANEXO IV – CRITÉRIOS A SEREM AVALIADOS NO CURRÍCULO LATTES

 

A coluna “Pontos Solicitados” da tabela abaixo deverá ser preenchida pelo candidato, e entregue no ato da inscrição, juntamente com o Currículo Lattes e os respectivos comprovantes.

 

TABELA DE PONTUAÇÃO DO CURRÍCULO LATTES

Nome do(a) Candidato(a): _______________________________

Cursos de Graduação, de Pós-graduação, e de Extensão em áreas afins (até o máximo de 30 pontos)

Item

Descrição

Pontuação

Pontos Solicitados

1

Curso de Graduação concluído em área afim

10 Pontos (máximo 10 pontos)

 

2

Cursos de Especialização concluídos em áreas afins

3 pontos por curso (até o máximo de 6 pontos)

 

3

Curso de Mestrado concluído em área afim

15 pontos (máximo 15 pontos)

 

4

Cursos de Extensão concluídos em áreas afins

0,5 ponto por curso (até o máximo de 3 pontos)

 

Atividades Acadêmicas e Profissionais (até o máximo de 20 pontos)

Item

Descrição

Pontuação

Pontos Solicitados

1

Iniciação Científica, Iniciação Tecnológica ou atividades correlatas em áreas afins

5 pontos por ano (até o máximo de 10 pontos)

 

2

Monitoria de Graduação ou Programa acadêmico equivalente em áreas afins

3 pontos por ano (até o máximo de 6 pontos)

 

3

Intercâmbio Institucional em áreas afins

2 pontos por intercâmbio (até o máximo de 4 pontos)

 

4

Participação em eventos científicos em áreas afins

1 ponto por evento (até o máximo de 3 pontos)

 

5

Participação em comissão organizadora de eventos científicos em áreas afins

1 ponto por evento (até o máximo de 3 pontos)

 

6

Cursos ministrados em áreas afins

1 ponto por curso (até o máximo de 3 pontos)

 

7

Experiência Profissional (incluindo estágio e empresa Jr.)

1 ponto por ano (até o máximo de 3 pontos)

 

Trabalhos completos publicados em anais de congressos ou encontros científicos em áreas afins

Item

Descrição

Pontuação

Pontos Solicitados

1

Trabalho Qualis A1

10 pontos por trabalho

 

2

Trabalho Qualis A2

9 pontos por trabalho

 

3

Trabalho Qualis A3

8 pontos por trabalho

 

4

Trabalho Qualis A4

7 pontos por trabalho

 

5

Trabalho Qualis B1

6 pontos por trabalho

 

6

Trabalho Qualis B2

4 pontos por trabalho

 

7

Trabalho Qualis B3

2 pontos por trabalho (até o máximo de 6 pontos)

 

8

Trabalho Qualis B4 ou B5

1ponto por trabalho (até o máximo de 3 pontos)

 

Artigos completos publicados em periódicos

Item

Descrição

Pontuação

Pontos Solicitados

1

Artigo Qualis A1 ou qualificado com JCR > 6

20 pontos por artigo

 

2

Artigo Qualis A2 ou qualificado com JCR > 5

16 pontos por artigo

 

3

Artigo Qualis A3 ou qualificado com JCR > 4

14 pontos por artigo

 

4

Artigo Qualis A4 ou qualificado com JCR > 3

12 pontos por artigo

 

5

Artigo Qualis B1 ou qualificado com JCR > 2

10 pontos por artigo

 

6

Artigo Qualis B2 ou qualificado com JCR > 1

5 pontos por artigo

 

7

Artigo qualificado no Qualis como B3, B4 ou B5

2 pontos por artigo (até o máximo de 8 pontos)

 

8

Artigo Qualis B4 ou B5

1 pontos por artigo (até o máximo de 4 pontos)

 

Outras Produções (até o máximo de 20 pontos)

Item

Descrição

Pontuação

Pontos Solicitados

1

Livros publicados em áreas afins

5 pontos por livro (até máximo de 10 pontos)

 

2

Capítulos de livros publicados em áreas afins

2 pontos por capítulo (até máximo de 6 pontos)

 

3

Resumos publicados em anais de congressos, seminários ou encontros científicos em áreas afins

1 ponto por resumo (até o máximo de 5 pontos)

 

4

Registro de patentes no INPI

5 pontos por registro

 

5

Patente concedida no INPI

10 pontos por patente

 

6

Registro de Software no INPI

5 pontos por registro

 

Pontuação Máxima do Currículo Lattes: 100 Pontos

Observação: O Qualis é um instrumento de avaliação da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). Será considerado as “classificações de periódicos quadriênio 2017-2020”. Para verificar se um determinado periódico possui Qualis, consulte o sítio do WebQualis em https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/veiculoPublicacaoQualis/listaConsultaGeralPeriodicos.jsf. Para verificar se um determinado congresso possui Qualis, verifique uma cópia do documento do Qualis dos congressos de nacionais e internacionais da área que o artigo foi publicado. Somente serão aceitos e considerados produções qualificadas nas áreas de Ciências Biológicas I, Ciência da Computação e Interdisciplinar. Na hipótese da produção em periódico ou conferência ser qualificada em mais de uma área de avaliação, será atribuída a qualificação de maior valor entre as áreas de Ciências Biológicas I, Ciência da Computação ou Interdisciplinar.


 

ANEXO V – MODELO DE CARTA DE RECOMENDAÇÃO

Atenção: esta carta deve ser preenchida preferencialmente por professor doutor.

 

INSTRUÇÕES

O(A) candidato(a) deve preencher o seu nome e enviar o formulário, ao recomendador(a) de sua escolha.

---

PARTE A (Preenchida pelo candidato)                        

Nome:...............................................................................................................................

 

---

PARTE B (Para ser preenchida pelo recomendante)

O(A) candidato(a) pretende ingressar no Curso de Doutorado do Programa de Pós-Graduação Associado em Bioinformática – Sede UTFPR-CP. Por favor, expresse sua opinião sobre o(a) candidato(a) nos itens abaixo. Essas informações são confidenciais.

 

1. Conheço o candidato(a) desde _________,  como:

[   ] Aluno(a) de graduação

[   ] Aluno(a) de pós-graduação

[   ] Aluno(a) de iniciação científica

[   ] Outros (especificar):_____________________________________________

 

2. Com relação ao candidato(a), fui seu:

[   ] Professor de (especificar): _________________________________________

[   ] Orientador de (especificar): ________________________________________

[   ] Chefe na empresa (especificar): ____________________________________

[   ] Colega na empresa (especificar): ___________________________________

[   ] Outros (especificar):______________________________________________

 

3. Faça um relato sobre a sua experiência com o candidato.

 

4. Se o candidato estivesse interessado em sua área de pesquisa, você o aceitaria como seu orientando de doutorado?

[   ] Sim, sem restrições

[   ] Não

[   ] Sim, com restrições

Especifique: ___________________________________________________

 

5. Como você avalia a experiência acadêmica do candidato, na área de concentração Bioinformática, em termos de conhecimentos teóricos e abrangência de formação? 

 

6. Como você avalia o desempenho do candidato nas atividades que acompanhou de perto, analisando sua dedicação, iniciativa, criatividade e motivação?

 

Comparando com ............. (número de estudantes/profissionais) estudantes/profissionais que conheci nos últimos ................ (número de anos) anos, eu classificaria o candidato da seguinte maneira:

 

 

Característica

 

Excelente

 

Bom

 

Na Média

 

Abaixo da

Média

 

Sem base para julgar

Capacidade Intelectual

         

Motivação para estudos avançados

         

Iniciativa e criatividade

         

Capacidade para trabalho individual

         

Capacidade para trabalho em grupo

         

Capacidade de expressão oral

         

Capacidade de expressão escrita

         

Potencial como pesquisador

         

Avaliação global

         
 

 

---

PARTE C (Dados do recomendante)

Nome:...........................................................................................................................

Instituição ou Empresa:.....……...................................................................................

Cargo: .................................................... E-mail/Telefone...........................................

Grau acadêmico mais alto: ........................................................

Ano de obtenção do grau: .........................................................

Área de sua especialidade: .......................................................

Endereço: .....................................................................................................................

 

Local e data:........................................................

 

......................................................................

Assinatura

---

Esta carta de recomendação deve ser enviada pelo recomendante diretamente para o PPGAB – Sede UTFPR-CP. 

Favor enviar a carta de recomendação em formato digital para “ppgab-cp@utfpr.edu.br” com o assunto: “Carta de Recomendação: Nome do Candidato”.

Se desejar enviar a carta de recomendação impressa, favor enviar para: 

UTFPR – Câmpus Cornélio Procópio

Diretoria de Pesquisa e Pós-Graduação –

A/C Secretaria do PPGAB (Carta de Recomendação)

Av. Alberto Carazzai, 1640, Cornélio Procópio, PR

CEP 86300-000

 

ANEXO VI – CRITÉRIOS A SEREM AVALIADOS NO PROJETO DE PESQUISA

TABELA DE PONTUAÇÃO DO PROJETO DE PESQUISA

Item

Critérios de Avaliação

Pontuação Máxima do Item

1. Título e Resumo

Clareza e coerência com o tema do projeto e a linha de pesquisa do o orientador indicado.

5

2. Introdução e Justificativa

Clareza e profundidade na definição dos problemas; objetividade na formulação das hipóteses e perguntas científicas; coerência com o tema do projeto e a linha de pesquisa do o orientador indicado.

25

3. Objetivos

Clareza, objetividade e originalidade; relevância dentro da área de concentração do Programa; coerência com o tema do projeto e a linha de pesquisa do o orientador indicado.

10

4. Revisão Bibliográfica

Revisão Bibliográfica atual, apresentada com formalismo acadêmico e pertinente ao tema do projeto.

20

5. Metodologia

Metodologia atual, apresentada com formalismo acadêmico e consistente com os objetivos, o tema do projeto e a linha de pesquisa do o orientador indicado.

20

6. Resultados e/ou Produtos e/ou Contribuições esperadas

Originalidade e relevância, dentro da área de concentração do Programa.

5

7. Cronograma

Organização, racionalidade e exequibilidade.

5

8. Bibliografia

Bibliografia atual e pertinente ao tema do projeto.

10

Pontuação Máxima do Projeto de Pesquisa: 100 Pontos

 

Referência: Processo nº 23064.058281/2022-64 SEI nº 3278682